13. 10. 2021 Jednodušší způsob, jak změřit spící ložiska u HIV pacientů

Nový test, který měří množství a kvalitu neaktivních HIV virů v genech lidí žijících s HIV, může nakonec výzkumníkům poskytnout lepší představu o tom, jaké léky fungují nejlépe v léčbě této nemoci. V současnosti neexistuje léčba infekce HIV a AIDS, ale antiretrovirové léky, neboli ART, účinně potlačí virus na neměřitelnou úroveň.

Studie publikovaná v časopise Cell Reports Medicine diskutuje, jak nový test, vyvinutý společně vědci z Lékařské fakulty Univerzity Washington a Výzkumného centra rakoviny Freda Hutchinsona, poskytne výzkumníkům, a nakonec i lékařům, jednodušší způsob k posouzení, kolik HIV může zůstávat v pacientově genomu (pozn. souhrnu všech genů jednotlivce). Tato spící zásobárna HIV (latentní rezervoár) je výsledkem začleněním HIV do DNA, specificky do chromozomů T lymfocytů (bílých krvinek) a makrofágů, uvedl Dr. Florian Hladik, senior autor článku a výzkumný profesor porodnictví a gynekologie Univerzity Washington. Současně doplnil, že virové začlenění do genomu hostitelské buňky je jedinečným rysem retrovirů.

Hladik dále uvádí, že současné testy jsou komplikované, drahé a občas poskytnou nepřesné zhodnocení virové nálože. Dva již existující testy jsou prováděny v laboratorních podmínkách sekvenováním virové DNA (pozn. „čtením“ struktury DNA) z pacientových buněk nebo vyvoláním funkčního virového růst z pacientových buněčných kultur. Oba testy jsou časově náročné a drahé a nehodí se jednoduše k testování nových kandidátů na léky na infekci HIV.

„Náš laboratorní test je jednodušší cestou k určení množství zásobárny neporušených virů,“ uvedl Dr. Hladik.

Hodnocení nových léčebných postupů k léčbě infekce HIV závisí na opakovaném měření počtu buněk, které obsahují DNA HIV před, během a po léčbě. Současné testy nepodávají informaci dostatečně rychle nebo s dostatečnou přesností, aby byly použitelné v budoucích klinických studiích. A některé testy vyžadují několik krevních odběrů od každého pacienta.

Claire Levy z Wahnigtonské univerzity řekla, že nový typ testu využívá výhody digitálních ddPCR testů (podtyp PCR testů). Zkoumá každou izolovanou molekulu DNA, nejen přítomnost začleněné HIV DNA, ale také určuje, jestli je virová DNA neporušená nebo defektní. Komerční software a speciálně navržená analýza se užívají k výpočtu množství T-buněk obsahujících neporušenou HIV DNA v genomu (pozn. souboru veškeré genetické informace). To nám dává více informací o konkrétním viru v těle pacienta než předchozí PCR testy.

Claire Levy dále uvedla, že předchozí testy byly pouze částečně účinné – jako vyhledávání informací online o někom, u nějž známe jenom křestní jméno. Když budeme pokračovat v této analogii, tak nové testy poskytují více informací, jako je celé jméno, věk a výška. V případě HIV, tato extra informace o viru pomůže vědcům pochopit, jak se chová v lidském těle.

Levy a Hladik vysvětlili, že prakticky tyto nové PCR testy pomohou výzkumníkům určit účinnost léku testovaného proti HIV/AIDS tím, že se pozorně vysleduje, kolik buněk s nedotčenou HIV DNA existuje po každé dávce.

„Dovedu si představit pacienta, který jde k lékaři, a přidá tento dotaz na seznam svých otázek. Teď se pacienti ptají na svou virovou nálož a počet T-buněk. Doufám, že se v budoucnu budou moci zeptat, jak velký může být jejich HIV rezervoár,“ řekl Hladik. „Jsem nadšený, že jednoho dne pacientům toto číslo ukáže, jak dlouho bude trvat, než se plně zbaví HIV ze svého těla.“

https://www.news-medical.net/news/20210412/New-test-offers-a-simpler-way-to-quantify-the-reservoir-of-intact-viruses-in-HIV-patients.aspx
Připravila: Veronika